Une équipe de scientifiques a confirmé que les enfants atteints de troubles du spectre autistique (TSA) ont un microbiome intestinal différent de celui des enfants neurotypiques et a découvert 31 marqueurs biologiques qui pourraient aider à diagnostiquer ce trouble.
Selon un communiqué de presse de l'EFE, les chercheurs pensent qu'à l'avenir, ces découvertes pourraient aider à découvrir si certains de ces composants du microbiome intestinal et leurs fonctions pourraient contribuer à provoquer l'autisme.
L'étude, dont les détails ont été publiés ce lundi dans la revue Nature Microbiology, a été réalisée par une équipe de scientifiques chinois dirigée par Siew Ng, de l'Université chinoise de Hong Kong (Chine).
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– Actualités Télémicro (@NTelemicro5) 8 juillet 2024
Le microbiome intestinal est l’ensemble des micro-organismes qui vivent dans l’intestin humain (microbiote), avec leurs gènes et métabolites.
On sait depuis longtemps qu’il existe une relation entre le microbiome intestinal et les TSA mais, jusqu’à présent, la plupart des études se sont concentrées sur les bactéries intestinales et n’ont pas étudié si les archées, les champignons et les virus du microbiome, leur fonction ou leurs gènes sont altérés. dans les TSA.
Pour le savoir, les chercheurs ont effectué le séquençage métagénomique d’échantillons fécaux provenant de 1 627 garçons et filles avec ou sans TSA, âgés de 1 à 13 ans, provenant de 5 cohortes en Chine.
Les auteurs ont analysé ces échantillons ainsi que des données sur des facteurs supplémentaires tels que le régime alimentaire, les médicaments et la comorbidité et ont identifié 14 archées, 51 bactéries, 7 champignons, 18 virus, 27 gènes microbiens et 12 voies métaboliques altérées chez les enfants atteints de TSA.
Ensuite, en utilisant l’apprentissage automatique, ils ont créé un modèle basé sur un panel de 31 microbes et fonctions, qui présentait une plus grande précision diagnostique dans l’identification des personnes atteintes de TSA par rapport aux panels de marqueurs du microbiome intestinal basés sur un seul règne (comme les bactéries ou les archées).
Les auteurs suggèrent que ces 31 marqueurs pourraient avoir un potentiel de diagnostic clinique compte tenu de leur reproductibilité dans plusieurs cohortes.
Ces résultats pourraient également contribuer à de futurs travaux visant à étudier la relation entre le microbiote intestinal et le diagnostic de TSA.
Impact de l'étude
Pour Bhismadev Chakrabarti, directeur de recherche du Autism Center de l'Université de Reading (Royaume-Uni), l'étude est importante car pour la première fois elle analyse le rôle des champignons, des archées et des virus dans l'autisme.
« De manière générale, les résultats coïncident avec ceux d’études précédentes qui reflètent une plus faible diversité microbienne chez les personnes autistes. De plus, il est basé sur l'un des plus grands échantillons observés dans une étude de ce type, ce qui renforce encore les résultats », souligne-t-il dans des déclarations au SMC.
Et bien que l’étude n’ait trouvé aucune preuve que le microbiote soit à l’origine de l’autisme, « elle ouvre la possibilité d’étudier des voies biochimiques spécifiques et leur impact sur différents traits autistiques » à l’avenir.
En outre, souligne-t-il, « cela pourrait offrir de nouvelles façons de détecter l’autisme, si les marqueurs microbiens renforcent la capacité des tests génétiques et comportementaux à détecter l’autisme ».
Dans le même ordre d'idées, Toni Gabaldón, professeur-chercheur à l'ICREA et responsable du groupe de génomique comparée de l'Institut de recherche biomédicale (IRB Barcelone) et du Centre de calcul intensif de Barcelone (BSC-CNS), souligne que l'étude s'appuie sur un nombre élevé de échantillons et prend également en compte d’autres facteurs liés à l’alimentation et au mode de vie qui affectent le microbiome intestinal.
On sait depuis longtemps que les enfants autistes ont un microbiote intestinal différent, mais la plupart des études se sont basées sur l’étude des bactéries. Cette étude « offre une vision beaucoup plus complète des changements métaboliques associés aux modifications du microbiote », souligne le chercheur espagnol.
Concernant la découverte des 31 biomarqueurs, Gabaldón rappelle qu'actuellement le diagnostic repose sur des modèles comportementaux qui apparaissent au fil du temps, donc « disposer de biomarqueurs précoces qui pourraient aider à détecter l'autisme plus tôt pourrait faciliter le début de thérapies plus précoces ».
« S'il existe des changements métaboliques qui influencent la progression des symptômes et pourraient être compensés par des régimes alimentaires ou l'utilisation de probiotiques, la modulation du microbiote ouvrirait la porte à de nouveaux traitements améliorant certains aspects », souligne Gabaldón.
