Le Brésil

logiciel pour enregistrer les signaux cardiovasculaires permet l’analyse simultanée de diverses données – Jornal da USP

PyBioS dispose actuellement de huit outils de prétraitement et de 15 méthodes d’analyse – Photomontage Camila Paim /Journal de l’USP à propos des images Freepik et Smashicons

Les logiciels utilisés pour mesurer les signaux cardiovasculaires – les signaux émis en fonction du cœur – sont courants et chacun présente des limites et des avantages en fonction des besoins de l’utilisateur. Le chercheur de l’École de médecine Ribeirão Preto (FMRP) de l’USP Luiz Eduardo Virgilio da Silva a développé un programme gratuit destiné à tous les types de signes cardiovasculaires, mais en mettant l’accent sur la variabilité de la fréquence cardiaque. PyBioS, logiciel développé en langage de programmation Python, offre de nombreuses fonctionnalités à l’utilisateur. Le système est encore en construction, mais peut être utilisé par quiconque en fait la demande.

Luiz Eduardo Virgilio, chercheur à la FMRP-USP – Photo: Collection personnelle

Avec une interface graphique conviviale, PyBioS recherche plus de commodité. «L’interface facilite son utilisation car sans elle, il faudrait connaître le langage de programmation, dans le cas de Python, pour pouvoir l’utiliser», explique Luiz Eduardo Journal de l’USP. Le programme propose également d’autres outils importants, tels que la correction des artefacts, qui répare automatiquement les erreurs de détection lors d’un électrocardiogramme; analyse de données par lots, qui permet l’analyse simultanée de nombreuses données et la simulation de signaux.

Les outils de simulation de signaux sont chargés de générer des signaux simulés dans lesquels il est possible de connaître leurs propriétés pour évaluer de nouvelles méthodes. «Je propose donc une méthode qui prévoit de quantifier l’imprévisibilité du signal», explique le chercheur. PyBioS dispose actuellement de huit outils de prétraitement et de 15 méthodes d’analyse. Les différentes méthodes mises en œuvre se concentrent sur l’analyse non linéaire et complexe des signaux et des séries chronologiques. La Fondation d’appui à la recherche de l’État de São Paulo (Fapesp) et la Coordination pour l’amélioration du personnel de l’enseignement supérieur (Capes) ont financé le projet.

Le chercheur dit que le projet est venu de sa propre demande. «J’ai commencé à créer le logiciel pour moi-même et pour d’autres dans le laboratoire ou sur le point de l’utiliser. Nous avons réalisé qu’au fur et à mesure que le logiciel évoluait, il pourrait être utile à davantage de personnes qui travaillent avec des signes cardiovasculaires. C’est à ce moment-là que l’idée de l’améliorer un peu et de la rendre publique »est venue, dit Luiz Eduardo.

Le programme est présenté plus en détail dans l’article PyBioS: un logiciel informatique gratuit pour l’analyse des signaux cardiovasculaires, publié en décembre 2020 dans la revue scientifique Méthodes informatiques et programmes en biomédecine.

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169260720315510?via%3Dihub

Prochaines étapes

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Publié: 25/08/2020

À la recherche de l’amélioration constante du système, la prochaine étape du chercheur consistera à ajouter des algorithmes d’apprentissage automatique au programme. «Ce mécanisme existe déjà en Python, ce qui manque est de l’amener à une interface graphique», explique Luiz Eduardo. Les algorithmes seraient utilisés pour classer et essayer de prendre les résultats de l’analyse et de comprendre les phénomènes.

Même si PyBioS n’est pas destiné à répondre aux besoins de tous les utilisateurs, il possède des fonctionnalités utiles dans de nombreuses situations. De plus, PyBioS est en constante évolution et plusieurs signaux simulés, outils et méthodes d’analyse n’ont pas encore été mis en œuvre. Il peut être appliqué pour mesurer les signaux de pression bruts sur les électrocardiogrammes – bien que vous ayez encore besoin de certains outils – et pour mesurer la variabilité de la fréquence cardiaque, votre point fort. Pour accéder au logiciel, il est nécessaire de contacter le chercheur et de demander l’outil.

Plus d’informations: luizeduardo@usp.br, avec Luiz Eduardo Virgilio

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