Avec l’arrivée de nouvelles maladies qui affectent l’homme, les données initiales fournies par les scientifiques peuvent ne pas être totalement absolues ou concluantes et il est toujours nécessaire d’approfondir les effets d’une pathologie et d’approfondir ses recherches. Dans le cas de la pandémie actuelle de Covid-19, qui est d’origine animale, les mutations acquises par Sars-Cov-2 ces derniers mois sont également inquiétantes, car elles peuvent entraîner une plus grande morbidité.
De nombreuses mutations et variations survenues dans des pays comme le Royaume-Uni, l’Afrique du Sud, l’Inde, les États-Unis et le Brésil sont connues, ce dernier cas étant le cas le plus emblématique car il y a eu non pas une, mais plusieurs mutations identifiées dans ce pays . Il existe maintenant une nouvelle variante appelée, récemment, par l’Organisation mondiale de la santé, lambda, également connue sous le nom d’andine, qui a été découverte pour la première fois en août 2020 au Pérou.
Cette variation andine, identifiée scientifiquement comme C.37, est dérivée de la lignée B.1.1.1. Certaines études assurent qu’il présente des caractéristiques similaires à des mutations plus préoccupantes en raison de sa capacité de transmission élevée, telles que P.1 d’origine brésilienne, en particulier de Manaus. Avec la cartographie génomique, il n’est pas encore possible de déterminer si elle est beaucoup plus dangereuse ou mortelle que d’autres.
Les scientifiques indiquent que davantage d’évaluations seront nécessaires pour déterminer l’importance qu’elle aura, mais ce qui est certain, c’est que son origine est partagée avec une lignée, B.1.1.1, qui circule depuis le début de la pandémie. Selon les autorités péruviennes, cette nouvelle variante est responsable d’au moins 80% des cas de la deuxième vague vécus par cette nation.
« Les études menées par l’Institut national de la santé et le Centre d’épidémiologie du ministère de la Santé ont confirmé la présence d’une nouvelle variante dans le pays : C.37. La variante a été évaluée et à partir d’avril une présence notable a été remarquée ; cette variante est dite préoccupante », a assuré le ministre péruvien Óscar Ugarte.
Fernando González, professeur de génétique à l’Université de Valence en Espagne, affirme que chaque virus Sars-CoV-2 possède un code génétique qui est représenté par des chaînes. Cet ensemble de caractères est appelé le génome viral, qui fournit des lignes directrices pour son fonctionnement et sa transmission à lui seul. Ils agissent comme une archive historique de l’évolution virale, c’est ainsi qu’à chaque fois qu’une personne est infectée, il y a la possibilité que le virus mute.
L’étude, publiée sur vrological.org, indique que cette nouvelle sous-lignée de B.1.1.1, maintenant C.37, « présente une délétion dans le gène ORF1a et des variantes préoccupantes (COV) B.1.1.7 (britannique), B .1.351 (d’Afrique du Sud) et P.1. (Brésil) », c’est-à-dire qu’il possède des propriétés de variantes considérées comme dangereuses et plus mortelles. De plus, il montre une délétion et de multiples mutations non synonymes dans le gène Spike.
Transmission et symptômes. L’OMS a indiqué cette semaine qu’elle observait le comportement épidémiologique du variant et son augmentation potentielle de la transmissibilité et de la résistance aux anticorps neutralisants.
« Très probablement, cette variante est plus transmissible car c’est la seule façon d’expliquer sa croissance rapide. Au Chili et au Pérou, elle a continué à progresser fortement, alors que dans la province de Buenos Aires elle représente déjà plus de 40 % des cas », a assuré Pablo Tsukayama, coordinateur du Laboratoire de génomique microbienne du Pérou.
Il a expliqué que les symptômes rapportés jusqu’à présent sont les mêmes que les autres variantes, et selon les rapports médicaux, les patients ont eu une fréquence plus élevée de problèmes intestinaux.
Présence dans les nations. Selon le dernier rapport de l’OMS, le lambda est associé à des taux de transmission communautaires substantiels dans plusieurs pays, dont le Pérou, le Chili, l’Argentine et l’Équateur.
Les autorités péruviennes ont signalé que, depuis avril de cette année, 81% de leurs cas de covid-19 ont été associés à cette nouvelle variante, alors qu’au Chili cela représente 32% des cas séquencés signalés au cours des 60 derniers jours et en Argentine 37% .
Quant au Venezuela, récemment le président de la République, Nicolás Maduro, a annoncé que cette variante avait été identifiée dans le pays dans les États de Zulia et Trujillo, pour lesquels il a ordonné le renforcement de la clôture épidémiologique.
Il existe trois principales variantes du virus
Selon les recherches, il existe trois variantes principales de Sars-Cov-2. La principale a été identifiée au Royaume-Uni, la seconde en Afrique du Sud et l’autre au Brésil.
Celui du pays européen, par exemple, a un plus grand potentiel de transmission, ce qui signifie qu’il se propage plus rapidement et plus facilement entre les personnes, et de cette façon la maladie est beaucoup plus grave et les taux d’hospitalisation effondrent les capacités de soins.
Dans le même ordre se trouve le Sud-Africain, mais le Brésilien a affiché un taux de mortalité élevé. Il doit également être clair que le virus ne peut pas muter s’il ne se réplique pas, c’est pourquoi l’utilisation et la préservation de mesures biosanitaires telles que le masque, la distanciation sociale, et maintenant, dans une grande partie du monde, la vaccination de masse est essentielle. . Cela contribue à réduire le nombre d’infections et à ralentir les nouvelles variantes ou mutations.
Pendant ce temps, la variante dite andine dérive de la lignée B.1.1.1, qui partage des caractéristiques similaires aux mutations mentionnées.
Variante et souche. Une variante ou une lignée est celle qui est analysée à travers un arbre phylogénétique dans lequel apparaissent tous les parents d’une mutation virale. Chaque occurrence directe se voit attribuer une ligne ou une série de chiffres et de lettres de l’alphabet, elle est identifiée en tenant compte de son ordre d’apparition et de sa composition génétique.
On sait qu’un virus a muté lorsque dans l’étude il est noté que certaines des lettres de son génome ont changé, et bien que des mutations se produisent tout le temps, elles ne sont pas toujours qualifiées comme telles, car elles partagent généralement le même ensemble de mutations, formant alors une variante.
Quant à la souche, elle est issue d’une mutation drastique de la chaîne génétique du virus. UK B.1.1.7 a au moins 23 mutations et est considéré comme un variant ; Jusqu’à présent, aucune nouvelle souche du virus qui cause le covid-19 n’a été identifiée.
En bref, le virus Sars-CoV-2 lui-même est l’une des différentes souches de la famille des coronavirus. Les deux types ou souches de coronavirus les plus connus à ce jour sont le Sars-CoV-2, trouvé fin 2019, qui provoque la maladie covid-19, et le Sars-CoV, qui provoque le syndrome respiratoire aigu détecté en 2002. .
